Kleks i wynalazek Filipa Golarza to film, który zabiera widza w fascynującą podróż po świecie wyobraźni, gdzie granice między rzeczywistością a fantazją zaczynają się zacierać. W tej niezwykłej opowieści Profesor Kleks musi stawić czoła nowemu zagrożeniu – technologii, która może zniszczyć dziecięce marzenia i wyobraźnię. Kiedy Kleks powraca do rzeczywistości, by powstrzymać zło, jego miejsce w Akademii tymczasowo zajmuje wierny ptak Mateusz, który, choć niepozorny, odgrywa ważną rolę w wydarzeniach.
Cały film pełen jest nieoczywistych pytań, które zmuszają do refleksji: czy miłość Ady Niezgódki do robota Alberta, który nie ma ludzkiego serca, może przywrócić mu zdolność do prawdziwego uczucia? Jak wynalazek Filipa Golarza, który obiecuje życie bez wyobraźni, wpłynie na dzieci i ich postrzeganie świata? Wreszcie, czy wyobraźnia, choć pozornie zagrożona przez postęp technologiczny, ma jeszcze moc, by zmienić bieg wydarzeń i pokonać chłodną machinę nowoczesnej technologii? To opowieść o poszukiwaniu równowagi między technologią a fantazją, o walce o to, co najbardziej ludzkie i najpiękniejsze w nas – naszą wyobraźnię.